Deducciones y prestaciones de nómina en México en 2025: lo que toda empresa debe saber 

Cuando una empresa mexicana calcula su nómina, debe considerar dos grandes componentes: las deducciones (los descuentos obligatorios o autorizados) y las prestaciones (los beneficios que la ley exige o las empresas ofrecen). Aunque suene técnico, entender qué son las deducciones y prestaciones de nómina en México es clave para evitar sanciones, costos ocultos y errores en el salario neto de los empleados. 

Si estás pensando en automatizar tu nómina o mejorar tu sistema de Recursos Humanos, conviene tener claridad sobre qué exige la ley, qué ha cambiado recientemente y cómo hacer los cálculos correctamente.

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¿Qué son las deducciones de nómina?

Las deducciones en nómina son los montos que se restan del salario bruto para llegar al salario neto que recibe el trabajador. Algunas deducciones son obligatorias por ley, y otras se aplican con autorización expresa del trabajador.Los siguientes son los tipos principales de deducciones: 

Deducciones obligatorias (retenciones legales)

• ISR (Impuesto Sobre la Renta): se retiene conforme a las tablas vigentes del SAT. En 2025, la tarifa mensual va de 1.92 % hasta 35 % según el nivel de ingresos. 
• Cuotas del IMSS / seguridad social: el trabajador y la empresa aportan para cobertura médica, invalidez, pensiones, etc. 
• INFONAVIT / fondo de vivienda: si el empleado tiene crédito de vivienda, se le descuenta para cubrirlo.  
• Aportaciones al retiro / cesantía / vejez: contribuciones para el fondo de retiro o AFORE. 
• Otras deducciones permitidas por la LFT (artículo 110): anticipos, daños, cuotas sindicales, pensiones, deudas con la empresa. Pero con límites: no pueden exceder montos máximos permitidos y necesitan autorización del trabajador.

Deducciones voluntarias

• Caja de ahorro.
• Préstamos internos. 
• Compra de equipo corporativo. 
• Cuotas a cooperativas.

Estas solo pueden aplicarse si el trabajador da su consentimiento libremente, y no deben vulnerar los límites legales. 

Límites y restricciones relevantes

• Las deducciones no permitidas pueden requerir devolución con intereses, multas o sanciones.
• En 2025, se actualizó el subsidio al empleo: el porcentaje pasó del 11.82 % al 13.8 %, lo cual afecta el cálculo neto para quienes tienen ingresos menores a cierto umbral (hasta 10,171 pesos mensuales). 
• La UMA (Unidad de Medida y Actualización) también cambió en 2025: tiene valor diario de 113.14 pesos, mensual de 3,439.46 pesos. Esto impacta límites fiscales y algunos subsidios. 

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¿Qué son las prestaciones laborales?

Las prestaciones son los derechos adicionales que los trabajadores reciben por la relación laboral, más allá del salario. Algunas son obligación legal (“prestaciones de ley”) y otras son mejoras ofrecidas por la empresa.

Prestaciones de ley más comunes en México (2025)

Las prestaciones laborales más que un “obligación legal”: también pueden marcar la diferencia para atraer y retener talento. 

• Aguinaldo: mínimo 15 días de salario al año (o proporcional si no se completa el año). 
• Vacaciones y prima vacacional: al primer año mínimo 12 días de vacaciones, con prima vacacional mínima del 25 %. 
• Participación de utilidades (PTU): los empleados tienen derecho al reparto de utilidades según la Ley. 
• Descanso semanal obligatorio: al menos 24 horas continuas. 
• Días festivos obligatorios: el trabajador debe gozar de los días festivos con goce de sueldo. 
• Licencia de maternidad / paternidad / incapacidad médica: la LFT contempla períodos de licencia para maternidad, y en algunos casos prestaciones de enfermedad o accidente. 
• Prima de antigüedad / indemnización en despido: cuando aplica la terminación de relación laboral, se debe pagar prima de antigüedad u otras indemnizaciones legales.

Además, muchas empresas ofrecen prestaciones superiores (bonos, seguro médico adicional, vales, capacitación, etc.) como parte de su estrategia de retención. Estas no son obligatorias, pero sí ayudan a posicionarte como un empleador competitivo.

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¿Cómo calcular deducciones y prestaciones en la nómina? (paso a paso)

Para calcular correctamente deducciones y prestaciones no basta con saber las leyes, también hay que tener buen sistema, datos correctos y procesos confiables. Algunos de los pasos que debes tener en cuenta al calcular las deducciones y prestaciones en la nómina son:

1. Determina el salario base de cotización (SBC): debe incluir las percepciones que integran la base para IMSS, AFORE, etc.
2. Aplica las deducciones obligatorias:
   • Calcular ISR con la tarifa correspondiente al nivel de ingresos (usando las tablas de 2025). 
   • Aplicar aportaciones al IMSS, INFONAVIT, retiro, etc. 
   • Restar otras deducciones legales autorizadas (préstamos, anticipos) si aplica. 
   • Considerar el subsidio al empleo para quien califique.
3. Determinar el salario neto: salario bruto menos las deducciones. 
4. Calcular prestaciones proporcionales (si aplica): 
   • Si el trabajador no completó el año, calcular el aguinaldo proporcional. 
   • Vacaciones proporcionales si no ha cumplido periodo completo. 
   • Prima vacacional proporcional. 
5. Registrar y reportar según el SAT / nómina digital: usar las claves de deducción del catálogo del SAT (001, 002, etc.) para cada retención. 

Con Softland RRHH, estos pasos se ejecutan automáticamente con reglas configurables, evitando errores manuales.

¿Qué ha cambiado en 2025 y por qué afecta tus cálculos?

Este año trajo ajustes que obligan a revisar la forma en que las empresas medianas calculan los pagos de nómina. El aumento al salario mínimo (12 %) impacta muchos cálculos, especialmente aquellos que tienen que ver con mínimos legales, límites de deducciones, y el subsidio al empleo. 

El nuevo cálculo del subsidio al empleo es otro gran cambio: además del porcentaje de la UMA, se modificó el umbral máximo de ingreso para poder recibirlo. Estas variaciones implican que algunos empleados que antes no lo recibían, ahora sí lo harán, y eso cambia cuánto retienes de ISR. 

También, aunque las tablas del ISR no se modificaron sustancialmente (las tarifas se mantienen similares) se deben revisar los niveles de ingreso, cuotas fijas y porcentajes para el excedente, ya que cambios en UMA, salario mínimo o subsidio al empleo pueden variar el “efecto neto” para el trabajador.

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Recomendaciones para empresas que buscan automatizar la nómina

Si gestionas RRHH o finanzas en una empresa, te conviene:

1. Adopta un sistema de nómina robusto: que permita configurar reglas fiscales, deducciones y prestaciones según cada año como Softland RRHH. 
2. Actualizaciones constantes del sistema: asegúrate de que el proveedor incorpore cambios del SAT, UMA, tarifas ISR y reformas laborales. 
3. Auditoría interna frecuente: revisa los cálculos de nómina cada período para detectar errores de configuración. 
4. Capacitación del equipo de nómina y RH: que conozcan los límites legales, deducciones permitidas y cómo interpretar reformas. 
5. Documentación clara ante el SAT: usar correctamente las claves del catálogo de deducciones, respaldar descuentos voluntarios con autorización, y mantener registros de prestaciones otorgadas. 
6. Simulaciones previas al cierre del ejercicio: especialmente si hay revisiones fiscales, para anticipar ajustes.

Un software que centralice nómina + recursos humanos, como Softland RRHH, y que esté alineado con reglas fiscales te reduce mucho el riesgo de multas, errores y retrabajos.

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Preguntas frecuentes sobre deducciones y prestaciones en la nómina mexicana (2025)

¿Qué deducciones se aplican al salario en México en 2025?

Las principales deducciones que se aplican al salario de los trabajadores son el ISR (Impuesto Sobre la Renta), las aportaciones al IMSS, las cuotas del INFONAVIT y las aportaciones al fondo de ahorro para el retiro (SAR). Estas deducciones son obligatorias y están reguladas por la ley. A veces también pueden aplicarse deducciones voluntarias, como préstamos o anticipos autorizados por el trabajador.

¿Cuáles son las prestaciones de ley en México para 2025?

Las prestaciones laborales mínimas que toda empresa debe otorgar son el aguinaldo, las vacaciones con prima vacacional, los días de descanso, la participación en utilidades (PTU) y las licencias de maternidad o incapacidad. Estas prestaciones están establecidas en la Ley Federal del Trabajo y no pueden omitirse, sin importar el tamaño de la empresa.

¿Cómo se calcula el ISR en la nómina 2025?

El cálculo del ISR se hace aplicando las tablas y tarifas vigentes del SAT según el nivel de ingresos del trabajador. Se toma el salario mensual, se restan las deducciones aplicables, y se determina el impuesto correspondiente. Si el trabajador tiene derecho al subsidio al empleo, este se aplica para reducir el monto del ISR retenido.

¿Qué es la UMA y por qué influye en la nómina?

La UMA (Unidad de Medida y Actualización) es un valor de referencia que se usa para calcular multas, créditos, cuotas y límites fiscales. En 2025, su valor mensual es de $3,439.46 pesos, y afecta directamente algunos topes legales y cálculos en prestaciones o deducciones, como el subsidio al empleo y el límite de exenciones.

¿Qué pasa si la empresa no aplica correctamente las deducciones o prestaciones?

Un error en los cálculos de nómina puede generar multas del SAT, sanciones del IMSS o problemas laborales con los trabajadores. Por eso es clave usar un sistema automatizado y actualizado que contemple todos los cambios fiscales y laborales de 2025.

¿Qué prestaciones adicionales pueden ofrecer las empresas medianas?

Además de las prestaciones de ley, muchas empresas ofrecen beneficios extra como vales de despensa, seguro médico privado, bonos de desempeño, horarios flexibles o apoyo para educación. Aunque no son obligatorios, estas prestaciones mejoran la satisfacción y retención del talento.

¿Cuál es la diferencia entre salario bruto y salario neto?

El salario bruto es el total que un trabajador gana antes de aplicar deducciones. El salario neto es lo que realmente recibe, después de restar impuestos, cuotas del IMSS, aportaciones al INFONAVIT y demás retenciones. Entender esta diferencia ayuda a evitar confusiones al revisar recibos de nómina.

¿Cuánto se descuenta por IMSS en 2025?

El descuento por IMSS depende del salario base de cotización del trabajador. En promedio, la aportación del trabajador ronda entre el 2.3 % y el 3.5 % de su sueldo, aunque puede variar según prestaciones o riesgos de trabajo. La empresa también aporta una parte importante al Instituto.

¿Cuánto se descuenta de ISR en México 2025?

El porcentaje del ISR depende del nivel de ingresos. Las tarifas del SAT 2025 van desde 1.92 % hasta 35 %, según el rango salarial mensual. Para saber cuánto te corresponde pagar, se aplica la tabla oficial publicada por el SAT y se resta el subsidio al empleo, si aplica.

¿Qué trabajadores tienen derecho al subsidio al empleo en 2025?

En 2025, el subsidio al empleo aplica para quienes ganan hasta $10,171 pesos mensuales. Si tu ingreso está dentro de ese rango, tu patrón debe aplicarlo automáticamente en el cálculo de tu nómina.

¿Qué pasa si mi empresa no me da prestaciones de ley?

Negar las prestaciones básicas —como aguinaldo, vacaciones o prima vacacional— es una violación a la Ley Federal del Trabajo. El trabajador puede acudir a la PROFEDET para presentar una queja y exigir el cumplimiento. La empresa puede recibir multas o sanciones económicas.

¿Cuándo se pagan las prestaciones obligatorias?

El aguinaldo debe pagarse antes del 20 de diciembre de cada año. Las vacaciones pueden disfrutarse después del primer año trabajado y deben incluir la prima vacacional del 25 %. La PTU (participación en utilidades) se paga entre abril y mayo, según el tipo de empresa.

¿Qué conceptos no deben considerarse deducciones?

No pueden descontarse de la nómina cosas como multas no autorizadas, pérdidas imputadas sin consentimiento, o castigos. Toda deducción debe tener respaldo legal o autorización expresa del trabajador.

¿Cómo se calcula la prima vacacional?

La prima vacacional equivale al 25 % del salario correspondiente a los días de vacaciones del trabajador. Por ejemplo, si alguien tiene derecho a 12 días de vacaciones y gana $500 diarios, su prima sería $1,500 adicionales. 

 ¿Cómo puedo saber si mi recibo de nómina está bien calculado?

Revisa que aparezcan tus percepciones, deducciones y aportaciones correctas, que el ISR retenido coincida con lo que indica la tabla del SAT según tu sueldo, y que se refleje el subsidio al empleo si aplica. Si detectas diferencias, puedes solicitar una aclaración al área de Recursos Humanos.

¿Cómo influye el salario mínimo en la nómina 2025?

El aumento del 12 % al salario mínimo para 2025 impacta directamente en los límites de ISR, el subsidio al empleo, las cuotas al IMSS y algunos topes legales de prestaciones. Si la empresa no actualiza su sistema de nómina, podría calcular retenciones incorrectas.

¿Qué diferencia hay entre UMA y salario mínimo en la nómina?

Aunque ambos valores se usan en cálculos laborales, la UMA se usa para definir límites legales (como multas o topes de exención), mientras que el salario mínimo se usa como base para calcular sueldos y prestaciones. En 2025, el salario mínimo es más alto que la UMA.

¿Cómo afecta la reforma de vacaciones dignas en 2025?

La reforma laboral de vacaciones dignas sigue vigente y establece que los trabajadores con un año cumplido tienen derecho a 12 días de vacaciones, que aumentan con la antigüedad. Esto influye en los costos de nómina, ya que se pagan con prima vacacional y deben considerarse en la planeación anual.

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Softland RRHH: automatización, cumplimiento y confianza

Con todos estos cambios, gestionar correctamente las deducciones y prestaciones de nómina en México no es opcional: es esencial para evitar sanciones, para mantener una relación justa con los colaboradores, y para asegurarte de que tu empresa no tenga sorpresas al cierre fiscal. 

En Softland entendemos esto. Nuestro ERP con módulo de nómina y Recursos Humanos integra las reglas legales mexicanas, se actualiza automáticamente con reformas como las de ISR, Subsidio al Empleo, UMA y salario mínimo, y te permite hacer simulaciones, reportes detallados, auditorías internas. Si te interesa, puedes contactarnos y obtener una asesoría gratuita y personalizada para tu empresa.