Qué es el ISR en la nómina: lo que toda empresa debe saber en México 

Cuando se habla de nómina, uno de los temas que siempre aparece es el ISR, o Impuesto Sobre la Renta. Muchas veces se piensa que es algo que afecta solo al empleado, pero en realidad impacta también de lleno al empleador: desde el cálculo, la retención, hasta los pagos al SAT. En este artículo te explicamos con detalle: qué es el ISR en la nómina, qué cambios hay para 2025, y cómo Softland puede ayudarte a manejarlo sin dolores de cabeza.

¿Qué es el ISR en la nómina?

El Impuesto Sobre la Renta (ISR) es un tributo directo que grava los ingresos de personas físicas y morales en México. En el ámbito laboral, se aplica sobre los salarios, prestaciones y cualquier percepción que aumente el ingreso del trabajador. Lo esencial es que la empresa tiene la obligación legal de retener este impuesto al trabajador, calcularlo correctamente y entregarlo al SAT. 

Si la empresa no asume la responsabilidad legal de retener y entregar este gravamen, puede ser objeto de multas, revisiones fiscales o incumplimientos que cuestan caro, no solo económicamente sino también en reputación interna. 

En resumen: el ISR en la nómina es la porción del salario o prestaciones que la empresa retiene del trabajador para cumplir una obligación fiscal. No es un monto que el empleado “paga” por separado, sino que se descuenta del pago bruto.

Te puede interesar: ¿Cómo implementar indicadores de resultados y predictivos en las empresas?

Cómo afecta el ISR al pago de nómina en México

El impacto del ISR en nómina se manifiesta en varias dimensiones. Para el empleado, reduce su salario neto: de lo que debería recibir “en bruto”, debe descontarse ISR (así como otras retenciones y aportaciones). Para la empresa, implica cargas operativas: tener que hacer cálculos, revisar tablas vigentes, procesar pagos provisionales, declarar, emitir los comprobantes, mantener respaldo documental y gestionar los plazos. 

Además, el ISR modifica la planeación financiera de nómina: la empresa debe saber con anticipación cuánto debe retener, cuándo debe enterar al SAT y cómo conciliar esas retenciones con su flujo de caja. Un error leve en el cálculo puede provocar desajustes, recargos o sanciones —y a la vez afectar la confianza del empleado si su recibo de nómina no cuadró bien. 

También es relevante que los empleados entiendan cómo se les hace esa retención. Si en el recibo de nómina se desglosan claramente percepciones, deducciones, ISR retenido y el neto que reciben, existe más transparencia. Esto reduce consultas internas constantes y mejora la percepción de justicia dentro de la empresa.

📲 ¡Contáctanos y obtén una asesoría gratuita! ✅

Aspectos clave que las empresas deben conocer sobre el ISR en nómina

Para que una empresa opere y entienda con seguridad qué es el ISR en la nómina en México, hay varios elementos que debe dominar:

Tablas vigentes y su aplicación

En 2025, las tarifas del ISR para sueldos y salarios no sufrieron cambios con respecto a los años anteriores, ya que la inflación no rebasó el umbral del 10 % que activa una actualización automática. Estas tarifas están publicadas en el Anexo 8 de la Resolución Miscelánea Fiscal del 30 de diciembre de 2024 y aplican desde el 1 de enero de 2025.

El rol del subsidio al empleo

Una diferencia importante para 2025 es la forma actualizada de calcular el subsidio al empleo, que actúa como un “colchón” fiscal para reducir el ISR retenido a personas con ingresos bajos. El decreto vigente establece que el subsidio ahora se determina con base en un porcentaje del valor mensual de la UMA, lo que fija una cuota.  

Para 2025 ese porcentaje es del 13.8 % aplicado a la UMA mensual, lo que da como resultado un monto aproximado de $475 MXN mensuales que sirve como tope del subsidio. Además, para acceder al subsidio los ingresos mensuales del trabajador no deben exceder los $10,171 MXN.

Límites, deducciones y ajustes permitidos

Dentro del cálculo de ISR sobre nómina pueden restarse deducciones permitidas, como cuotas al IMSS, aportaciones obligatorias, algunas prestaciones, etc. Pero también es importante respetar límites legales, sobre todo cuando se trate de deducciones personales del trabajador u otras partidas que pudieran estar sujetas a topes.

Pagos provisionales y declaración anual

La empresa debe hacer retenciones y enterar el ISR retenido mes a mes (pagos provisionales), y, además, al cierre del ejercicio fiscal, presentar la declaración anual correspondiente. El cumplimiento puntual es fundamental para evitar sanciones o multas.

Actualización continua

Aunque en 2025 no hubo cambio en tarifas, la empresa debe estar pendiente de futuras reformas fiscales, cambios en la UMA o nuevos decretos que modifiquen la forma de cálculo del ISR o del subsidio al empleo.

Puedes leer sobre: ¿Qué es la automatización de procesos y por qué implementarla en tu empresa?

¿Cómo se calcula el ISR en nómina? Ejemplo para 2025

Para hacer el cálculo de ISR en una nómina correctamente, el proceso suele seguir estos pasos (apuntando al caso mensual como el más habitual):

1. Determinar el salario bruto o percepciones totales del trabajador para el periodo (mensual, quincenal, semanal, etc.). 
2. Restar deducciones autorizadas: cuotas de seguridad social, aportaciones obligatorias, prestaciones sujetas, que la ley permite restar para obtener la base gravable. 
3. Ubicar en la tabla de ISR aplicable el rango que corresponde a esa base gravable (es decir, el límite inferior apropiado, la cuota fija y el porcentaje marginal). 
4. Calcular el excedente al límite inferior: base gravable menos límite inferior. 
5. Aplicar el porcentaje marginal sobre ese excedente. 
6. Sumar la cuota fija establecida para ese tramo. 
7. Restar el subsidio al empleo que aplica para ese trabajador, si cumple con los criterios. 
8. Obtener el ISR retenido final: ese importe es el que debe retener la empresa y enterar al SAT. 

Para ilustrar, supongamos un trabajador con salario mensual bruto de $15,000 MXN. Según las tablas de ISR 2025, el tramo que aplica para ese monto tiene un límite inferior de $12,935.83 con una cuota fija de $1,182.88 y porcentaje marginal de 17.92 %. Entonces: 

• Excedente: 15,000 – 12,935.83 = 2,064.17 
• ISR marginal: 2,064.17 × 0.1792 ≈ 369.89 
• ISR preliminar: 369.89 + 1,182.88 = 1,552.77 
• Luego restar el subsidio al empleo correspondiente (suponiendo que el trabajador aplica para él), digamos $475 MXN, resultaría en una retención final aproximada de 1,077.77 MXN.

Este ejemplo es ilustrativo: en la práctica hay que usar tablas exactas, condiciones específicas del trabajador y criterios del subsidio aplicables. 

Consecuencias para las empresas si no se considera bien el ISR

No aplicar correctamente estos cambios puede traer varias complicaciones:

• Retenciones incorrectas que terminan en reclamos de empleados o ajustes posteriores, lo que puede generar descontento interno. 
• Multas, recargos y sanciones fiscales si no se entregan al SAT las retenciones o si se usan tablas o parámetros desactualizados. 
• Desajustes en el flujo de caja: si calculas mal el monto del ISR que debes enterar, puedes quedar con obligaciones mayores de lo previsto. 
• Mayor carga administrativa al tener que hacer correcciones, emitir nóminas complementarias o rectificar recibos. 

Por eso es crítico mantener los sistemas de nómina bien actualizados, capacitar al personal de contabilidad/recursos humanos, y realizar revisiones periódicas internas para asegurar que los cálculos de ISR se ajustan a la ley vigente. 

✅ ¡Escríbenos y recibe una asesoría gratuita! 📲

Preguntas frecuentes sobre el ISR en la nómina

¿Qué significa que se “retenga” el ISR en la nómina?

La retención de ISR es el mecanismo mediante el cual la empresa descuenta del salario del trabajador el monto correspondiente al Impuesto Sobre la Renta que le aplica, para entregarlo al SAT en su nombre. Es decir, el empleado no lo paga directamente, sino que la empresa lo retiene y lo entera al fisco.

¿Quiénes están obligados a que se les retenga ISR en su salario?

Toda persona física que reciba ingresos por concepto de salarios, sueldos, prestaciones o cualquier percepción gravable, salvo excepciones legales. La empresa que otorga esos pagos es responsable de aplicar la retención cuando la remuneración exceda los límites exentos que la ley establezca.

¿Cuándo no se debe retener ISR de un trabajador?

En ciertas condiciones la ley exime o releva la retención. Por ejemplo, cuando el trabajador solo percibe un salario mínimo correspondiente a su zona geográfica y no tiene otras percepciones, no se le aplica retención. Este caso aplica especialmente en la Zona Libre de la Frontera Norte.

¿Cómo se calcula el ISR que debo retener en nómina?

Se sigue un proceso: determinar el salario gravable del trabajador, ubicarlo en la tabla vigente (tramo que le corresponde), calcular el excedente sobre el límite inferior, aplicar la tasa marginal, agregar la cuota fija del tramo y restar el subsidio al empleo aplicable.

¿Dónde puedo consultar las tablas de ISR vigentes (2025)?

Las tablas oficiales se publican como parte del Anexo 8 de la Resolución Miscelánea Fiscal (RMF) en el Diario Oficial de la Federación y en el portal del SAT.

¿Qué es el subsidio al empleo y cómo reduce la retención de ISR?

El subsidio al empleo es un beneficio fiscal que reduce la carga del ISR para trabajadores con ingresos bajos o medios. En 2025, su cálculo se basa en un porcentaje del valor mensual de la UMA y se aplica solo si el trabajador califica bajo los límites establecidos.

¿Cuál es el límite de ingresos para poder recibir el subsidio al empleo en 2025?

En 2025, un trabajador puede recibir el subsidio al empleo si sus ingresos no superan los $10,171 MXN mensuales. Si excede ese monto, no aplica el subsidio.

¿Qué pasa si la empresa usa una tabla antigua para calcular ISR?

Retener con tablas desactualizadas puede causar que el monto retenido sea incorrecto (mucho mayor o menor), y el patrón podría ser sujeto de sanciones, requerimientos fiscales o ajustes en auditoría. Es vital asegurarse de estar usando siempre las tablas más recientes.

¿Cada cuánto debo enterar el ISR retenido al SAT?

Las retenciones de ISR deben enterarse periódicamente (mensual, de acuerdo con las obligaciones del patrón). Además, al cierre del ejercicio fiscal, la empresa debe presentar su declaración anual correspondiente.

¿Puede generarse un saldo a favor para el trabajador por ISR retenido?

Sí, al final del ejercicio, si las retenciones que se aplicaron fueron mayores a lo que realmente correspondía, puede generarse un saldo a favor que el trabajador (o en su caso la persona física) puede solicitar en su declaración anual.

¿Qué deducciones pueden tomarse en cuenta en el cálculo de ISR en nómina?

Algunas deducciones permiten reducir la base gravable: cuotas al IMSS, aportaciones obligatorias, prestaciones permitidas, entre otras. En el ámbito personal, también se consideran deducciones personales como gastos médicos, colegiaturas, intereses reales, siempre que cumplan los requisitos legales.

¿Qué debo hacer cuando un trabajador tiene varios patrones en el mismo mes?

Cuando un trabajador tiene más de un patrón en un mismo periodo, cada patrón debe hacer su cálculo de retención conforme a lo que paga, pero el trabajador al final puede estar obligado a declarar sus ingresos acumulados y ajustar en su declaración anual.

¿Qué sucede si retengo menos ISR del que correspondía?

Si la retención es insuficiente, la empresa puede enfrentar sanciones fiscales o recargos. Además, en auditorías el SAT puede requerir los montos correctos y aplicar multas o ajustes. Es responsabilidad del patrón asegurarse de que el cálculo sea correcto.

¿Cómo afecta el valor de la UMA al cálculo del ISR y subsidio?

El valor de la Unidad de Medida y Actualización (UMA) es fundamental para determinar parámetros del subsidio al empleo y otros beneficios fiscales. Un ajuste en la UMA impacta directamente el monto del subsidio y las retenciones netas.

Aprende sobre: Sistema integrado de gestión: ¿Qué es y cómo implementarlo?

Cómo Softland facilita el manejo del ISR en nómina

En Softland México sabemos que manejar nómina no es solo capturar cifras: se trata de manejo normativo, precisión, cumplimiento, y ahorrar tiempo. Nuestras soluciones ERP / RRHH están diseñadas para adaptarse automáticamente a los cambios fiscales como los de UMA, subsidio al empleo e ISR. Con nuestros sistemas puedes:

• Automatizar los cálculos para cientos de empleados, sin tener que estar revisando versiones de tablas manualmente. 
• Actualizar automáticamente los parámetros fiscales (UMA, subsidio, tablas de servicios salariales, etc.). 
• Generar recibos electrónicos claros para los colaboradores, con desglose de todas las partidas relevantes. 
• Obtener reportes de las retenciones, conciliaciones fiscales y alertas si algo no cuadra. 
• Reducir riesgos fiscales, errores humanos y ahorrar tiempo que puedes dedicar a lo estratégico.

Si tu empresa aún hace estos cálculos de forma manual o con sistemas antiguos, te invitamos a conocer Softland: contáctanos para agendar una asesoría gratuita y mostrarte con una demo cómo nuestra plataforma te asegura que el ISR en nómina siempre esté bien calculado, actualizado y cumplido.